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O presente artigo traz um estudo de caso para a região do Vale do Itajaí no final de 2008, com o intuito de discutir a possibilidade de traçar cenários de risco de surtos de Leptospirose em situações pós desastres hidrológicos. Para tal esforço, têm-se como base a relação entre: i) a detecção da ameaça, ou seja, a presença do agente etiológico na região, e ii) a vulnerabilidade da área, agravada fortemente após a ocorrência de desastres naturais hidrológicos. No caso do Vale do Itajaí, tendo como base o monitoramento de precipitação, vazão e nível do rio Itajaí, e valendo-se da relação acima citada, as análises apresentadas neste artigo ilustram a possibilidade de traçar cenários de risco de surgimento de surtos de Leptospirose com antecedência de cerca de 3 semanas em relação ao pico da doença.