Sejak tahun 2010 sampai dengan tahun 2012 insiden Infeksi menular seksual (IMS) di Kota Denpasar mengalami peningkatan. Penelitian ini bertujuan untuk memberikan gambaran kejadian IMS di Kota Denpasar tahun 2016 dan faktor-faktor yang mempengaruhinya. Penelitian ini merupakan penelitian analitik dengan pendekatan cross sectional menggunakan data rekam medis pasien yang melakukan pemeriksaan IMS (data tercatat pada SIHA IMS) periode Januari sampai dengan Desember 2016 di empat puskesmas di Kota Denpasar. Analisis dilakukan secara univariat dan bivariate dengan chi square test. Penelitian ini menunjukkan bahwa dari total 1397 reponden, sebanyak 18, 2% didiagnosis positif IMS). Hasil analisa bivariat menunjukkan faktor yang signifikan terhadap kejadian IMS adalah responden pelanggan PSK (OR= 2, 3 95% CI: 1, 7-3, 2; p< 0,001), bekerja (OR= 2, 2; 95% CI: 1, 7-2, 9; p< 0,001), laki-laki (OR= 1, 6; 95% CI: 1, 2-2, 1; p= 0,001) dan sudah menikah (OR= 1, 4; 95% CI: 1, 1-1, 9; p= 0.014). Diharapkan pada masingmasing puskesmas agar kegiatan penjangkauan yang selama ini ada dapat menyasar pelanggan PSK sebagai salah satu kelompok dengan risiko IMS.