Os reservatórios brasileiros vêm sofrendo grandes pressões antrópicas devido ao contínuo aumento populacional, que por sua vez, exerce grandes pressões sobre o meio ambiente. Diante dessa problemática, este estudo objetivou analisar a influência do uso do solo sobre a qualidade e genotoxicidade da água no reservatório de Itupararanga, São Paulo, Brasil. Para isso, coletas de água e sedimento foram analisadas em relação à sua qualidade, genotoxicidade e diversidade bentônica, assim como sua inter-relação com a paisagem. O reservatório mostrou-se eutrofizado na maioria das estações amostrais e foram encontradas alterações genéticas nas células do meristema radicular de Allium cepa expostas em algumas estações amostrais, além de apresentar baixa diversidade de organismos bentônicos. Dentre as variáveis que mais contribuíram para as alterações genéticas e para a qualidade da água estão a presença de vegetação ripária, o solo exposto e a ocupação urbana. Com os resultados obtidos através deste estudo foi possível concluir que o reservatório de Itupararanga está comprometido em relação à qualidade da água e do sedimento, necessitando de manejos emergências para garantir a sustentabilidade desse recurso hídrico.