Se utilizó una combinación de índices univariados, análisis gráficos y técnicas multivariadas para analizar cualitativa y cuantitativamente la composición taxonómica, estructura comunitaria y patrón de distribución espacial del ictioplancton en la región costera del Pacífico colombiano (zona de influencia de la Corriente de Colombia), considerando simultáneamente el grado de relación con los factores ambientales de temperatura, salinidad y clorofila-a durante la fase terminal del período cálido ENOS 2006-2007. En total se colectaron 543 larvas de peces, pertenecientes a 87 especies de 37 familias, destacándose por su abundancia la familia Myctophidae (26%) y Bregmacerotidae (17%). La variabilidad espacial de la abundancia y de las variables abióticas analizadas sugieren una alta homogeneidad biótica (ictioplancton) y abiótica en la zona de estudio. Sin embargo, al comparar los resultados obtenidos durante esta investigación con trabajos previos, se estableció que El Niño 2006-2007 afectó drásticamente la estructura y abundancia del ictioplancton en la zona costera del Pacífico colombiano, confirmando además que la Corriente Colombia es el principal agente modulador de la distribución espacial de ictioplancton en esta región.