Microsatellite isolation and characterization in sunflower (Helianthus annuus L.)

N Paniego, M Echaide, M Muñoz, L Fernández… - …, 2002 - cdnsciencepub.com
N Paniego, M Echaide, M Muñoz, L Fernández, S Torales, P Faccio, I Fuxan, M Carrera…
Genome, 2002cdnsciencepub.com
Le développement et caractérisation de marqueurs microsatellites chez le tournesol
(Helianthus annuus) ont été accomplis pour estimer leur fréquence, naturesse (structure),
niveau du polymorphisme, utilité pour l'identification et calcule des relations génétiques
entre lignées endocries qui représentent la diversité génétique du tournesol. L'isolement a
été accompli en utilisant une banque génomique de petits inserts de tournesol. Dans ce but,
le criblage basé sur l'hybridation a été effectué en utilisant des sondes oligonucléotidiques …
Le développement et caractérisation de marqueurs microsatellites chez le tournesol (Helianthus annuus) ont été accomplis pour estimer leur fréquence, naturesse (structure), niveau du polymorphisme, utilité pour l'identification et calcule des relations génétiques entre lignées endocries qui représentent la diversité génétique du tournesol. L'isolement a été accompli en utilisant une banque génomique de petits inserts de tournesol. Dans ce but, le criblage basé sur l'hybridation a été effectué en utilisant des sondes oligonucléotidiques composées de différents arrangements de nucléotides. 503 clones microsatellites positifs ont été séquences et 271 séquences d'amorces adjacentes à ces microsatellites ont été synthétisées. Pour l'évaluation du polymorphisme, 16 sources de accessions du H. annuus ont été vérifiées et 170 des amorces testées ont montré un polymorphisme pour les lignées étudiées. Les microsatellites polymorphiques ont produit une moyenne de 3.5 allèles par gène et une moyenne de 0.5 PIC (contenu en information de polymorphisme). Les motifs les plus fréquemment trouvés dans les SSR polymorphes étaient: (GA)n, (GT)n, (AT)n, suivis des trinucléotides (ATT)n, (TGG)n et (ATC)n et du tetranucléotide (CATA)n. La majeure partie des 170 séquence simple répétitive (SSR) obtenues ont montré des différences importantes dans les 16 lignées pures de référence utilisées pour sa caractérisation, 20 des SSR les plus instructives en termes d'information destinée à la détermination de génotypes de tournesol, et d'empreintes digitales dans un but légal, sont amplement décrits dans ce travail.Mots clés : tournesol, marqueur moléculaire, microsatellites, séquence simple répétitive.[Traduit par la Rédaction]
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