Systems and synthetic biology approaches in understanding biological oscillators

Z Li, Q Yang - Quantitative Biology, 2018 - Wiley Online Library
Background Self‐sustained oscillations are a ubiquitous and vital phenomenon in living
systems. From primitive single‐cellular bacteria to the most sophisticated organisms …

Discrete gene replication events drive coupling between the cell cycle and circadian clocks

J Paijmans, M Bosman… - Proceedings of the …, 2016 - National Acad Sciences
Many organisms possess both a cell cycle to control DNA replication and a circadian clock
to anticipate changes between day and night. In some cases, these two rhythmic systems …

The cyanobacterial circadian clock couples to pulsatile processes using pulse amplitude modulation

C Ye, CN Micklem, T Saez, AK Das, BMC Martins… - Current Biology, 2024 - cell.com
Cellular processes are dynamic and often oscillatory, requiring precise coordination for
optimal cell function. 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 How distinct oscillatory processes can couple within a …

Robustness of synthetic oscillators in growing and dividing cells

J Paijmans, DK Lubensky, P Rein ten Wolde - Physical Review E, 2017 - APS
Synthetic biology sets out to implement new functions in cells, and to develop a deeper
understanding of biological design principles. Elowitz and Leibler [Nature (London) 403 …

Synchronization of a genetic oscillator with the cell division cycle

G Knotz, U Parlitz, S Klumpp - New Journal of Physics, 2022 - iopscience.iop.org
Genetic circuits that control specific cellular functions are never fully insulated against
influences of other parts of the cell. For example, they are subject to periodic modulation by …

[PDF][PDF] A computational study of the robustness of cellular oscillators

JJ Paijmans - 2017 - ir.amolf.nl
Throughout history, people have tried to accurately measure time to predict the rhythmic
changes caused by the sun. Dating back to earliest days of civilization, by using the position …

Molecular Circuits of Biological Oscillators

Z Li - 2019 - deepblue.lib.umich.edu
A variety of biological systems, including the circadian clock, heartbeat, and cell cycle,
display rhythmic oscillating activities. Early genetic studies have identified central genes …

[PDF][PDF] Мережева основа функціонування біологічних осциляторів—тригерів коливальних ланцюгів у клітинах і безклітинних системах. Аналітичний огляд

ОП Мінцер, ВМ Заліський… - Медична інформатика …, 2019 - irbis-nbuv.gov.ua
В аналітичному дослідженні розглядаються експериментальні та теоретичні
дослідження в області кількісного системного аналізу ролі біологічних осциляторів …

Мережева основа функціонування біологічних осциляторів—тригерів коливальних ланцюгів у клітинах і безклітинних системах. Аналітичний огляд

ЛЮ Бабінцева, ВМ Заліський, ОП Мінцер - 2019 - ir.nuozu.edu.ua
В аналітичному дослідженні розглядаються експериментальні та теоретичні
дослідження в області кількісного системного аналізу ролі біологічних осциляторів …

Microfluidic Advancements in Quantitative Microbiology

ME Dueck - 2016 - escholarship.org
Microfluidic technologies have allowed modern microbiologists the opportunity to explore
biological phenomenon in ground-breaking new ways. The rapid prototyping capability of …