Statistical estimates of multiple transcription factors binding in the model plant genomes based on ChIP-seq data
AI Dergilev, NG Orlova, OB Dobrovolskaya… - Journal of integrative …, 2022 - degruyter.com
The development of high-throughput genomic sequencing coupled with chromatin
immunoprecipitation technologies allows studying the binding sites of the protein …
immunoprecipitation technologies allows studying the binding sites of the protein …
An efficient method to transcription factor binding sites imputation via simultaneous completion of multiple matrices with positional consistency
WL Guo, DS Huang - Molecular BioSystems, 2017 - pubs.rsc.org
Transcription factors (TFs) are DNA-binding proteins that have a central role in regulating
gene expression. Identification of DNA-binding sites of TFs is a key task in understanding …
gene expression. Identification of DNA-binding sites of TFs is a key task in understanding …
BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration
Gene expression regulation is one of the priority topics for bioinformatics development. The
topic was one of background research areas for the Journal of Integrative Bioinformatics [1 …
topic was one of background research areas for the Journal of Integrative Bioinformatics [1 …
Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК
АМ Спицина, ЮЛ Орлов… - … системы: теория и …, 2015 - cyberleninka.ru
Развитие технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК привело к
появлению нового класса объемных геномных данных и алгоритмов их обработки и …
появлению нового класса объемных геномных данных и алгоритмов их обработки и …
Программы анализа геномных данных секвенирования, полученных на основе технологий ChIP-seq, ChIA-PET и Hi-C
ЕВ Кулакова, АМ Спицина, НГ Орлова… - … системы: теория и …, 2015 - cyberleninka.ru
Возрастающие объемы геномных данных о положении сайтов связывания
транскрипционных факторов, хромосомных контактах, аннотации геномных …
транскрипционных факторов, хромосомных контактах, аннотации геномных …
Computer analysis of colocalization of the TFs' binding sites in the genome according to the ChIP-seq data
AI Dergilev, AM Spitsina, IV Chadaeva… - Russian Journal of …, 2017 - Springer
A computer program for calculating clusters of binding sites of various transcription factors
(TFs) according to the genomic coordinates of the ChIP-seq (Chromatin …
(TFs) according to the genomic coordinates of the ChIP-seq (Chromatin …
Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК
АМ Спицина, ЮЛ Орлов, НН Подколодная… - … системы: теория и …, 2016 - elibrary.ru
Развитие технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК привело к
появлению нового класса объемных геномных данных и алгоритмов их обработки и …
появлению нового класса объемных геномных данных и алгоритмов их обработки и …
Компьютерный анализ совместной локализации сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме по данным ChIP-seq
АИ Дергилев, АМ Спицина, ИВ Чадаева… - … журнал генетики и …, 2017 - vavilov.elpub.ru
Аннотация Разработана компьютерная программа расчета кластеров сайтов
связывания различных транскрипционных факторов (ТФ) по данным геномных …
связывания различных транскрипционных факторов (ТФ) по данным геномных …
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
KA Hossain - 2023 - mostwiedzy.pl
My PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific
DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play …
DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play …
Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекc ExpGene
АМ Спицина, АО Брагин, АИ Дергилев… - … системы: теория и …, 2017 - cyberleninka.ru
Технологии высокопроизводительного секвенирования ДНК позволяют получать
данные экспрессии генов в масштабе генома, как на микрочипах, так и на основе …
данные экспрессии генов в масштабе генома, как на микрочипах, так и на основе …